古代马其顿帝国在巴尔干半岛兴起，其先后隶属于罗马帝国和奥斯曼帝国。

1913年巴尔干战争后分属于南斯拉夫、希腊和保加利亚三国。区内主要城市有萨洛尼卡、斯科普里。地理上的马其顿地区现在分属三国。马其顿共和国称瓦尔达尔马其顿，属于保加利亚的部分称皮林马其顿，属于希腊的部分称爱琴马其顿。

第一次世界大战后瓦尔达尔马其顿并入塞尔维亚人-克罗地亚人-斯洛文尼亚人王国（1929年改称南斯拉夫王国）。

第二次世界大战后，南斯拉夫联邦人民共和国成立，原属塞尔维亚的瓦尔达尔马其顿成为南斯拉夫联邦的组成单位之一，称马其顿共和国。

1991年11月20日，马其顿正式宣布独立。但希腊认为马其顿是地理概念，其范围包括希腊的北部地区，坚决反对将“马其顿”或“马其顿”的派生词作为马的国名。

1993年4月7日，马其顿以“前南斯拉夫马其顿共和国”的暂时名称加入联合国。保加利亚虽然承认马其顿的独立并与之建交，但不承认马其顿民族和马其顿语。